Σχεδιάζει, συντονίζει ή/και υλοποιεί τις εθνικές στρατηγικές και πολιτικές για τους ελέγχους και επιθεωρήσεις ως προς την τήρηση της νομοθεσίας και των προδιαγραφών της αγροδιατροφικής αλυσίδας.
Υλοποιεί προγράμματα ελέγχων για την αγροδιατροφική αλυσίδα.
Εντοπίζει, καταγράφει και αντιμετωπίζει προβλήματα που συνδέονται με μη συμμορφώσεις του αντικειμένου του ελέγχου.
Ενημερώνεται διαρκώς και εκπαιδεύεται για το αντικείμενο των ελέγχων και επιθεωρήσεών του.
Υποστηρίζει τις διαδικασίες κατάρτισης των κανονισμών και διαδικασιών ελέγχου/επιθεωρήσεων επιχειρήσεων-φορέων, ενημέρωσης των υπηρεσιών του Οργανισμού και των φορέων που δραστηριοποιούνται στα αντικείμενα αυτά σχετικά με τις εν λόγω διαδικασίες και συντάσσει σχετικές εισηγήσεων για τη σύναψη σχετικών συνεργασιών.
Υποστηρίζει τις διαδικασίες σχεδιασμού, συντονισμού και διενέργειας των ελέγχων και δειγματοληψιών για τα προϊόντα που πιστοποιεί ο Οργανισμός, παραλαβής και διαβίβασης των πορισμάτων τους στο αρμόδιο Τμήμα Πιστοποίησης Αγροτικών Προϊόντων, καθώς τροφοδότησης των σχετικών βάσεων δεδομένων του Οργανισμού με τα αποτελέσματά τους.
Συμμετέχει στις διαδικασίες διενέργειας επιθεωρήσεων, ελέγχων και δειγματοληψιών στους Ιδιωτικούς Φορείς, στους συμβεβλημένους με αυτούς επιχειρηματίες και στα σημεία πώλησης των προϊόντων βιολογικής γεωργίας, υποστηρίζει τις διαδικασίες παραλαβής και διαβίβασης των πορισμάτων τους στο αρμόδιο Τμήμα Επίβλεψης Ιδιωτικών Φορέων και Προδιαγραφών.
Υποστηρίζει τις διαδικασίες συλλογής στοιχείων στο πλαίσιο των προβλεπόμενων διατάξεων ελέγχου.
Ελέγχει την ορθή χρήση των βεβαιώσεων, των πιστοποιητικών και των σημάτων που απονέμει ο Οργανισμός και υποστηρίζει τις διαδικασίες διαβίβασης των σχετικών αποτελεσμάτων στα αρμόδια Τμήματα Πιστοποίησης Αγροτικών Προϊόντων και Επίβλεψης Ιδιωτικών Φορέων και Προδιαγραφών.
Συμμετέχει στις διαδικασίες διενέργειας ελέγχων σε σημεία χονδρικής και λιανικής πώλησης προϊόντων, για προϊόντα τα οποία πιστοποιεί ο Οργανισμός, επεξεργάζεται τα αποτελέσματά τους και υποστηρίζει τις διαδικασίες οποιονδήποτε ενεργειών που απορρέουν από τη νομοθεσία, όσον αφορά τη συνδρομή άλλων φορέων του δημοσίου.
Διερευνά καταγγελίες σε θέματα αρμοδιότητας του Τμήματος και συνεργάζεται προς τούτο με τα αρμόδια στελέχη των Τμημάτων Πιστοποίησης Αγροτικών προϊόντων και Επίβλεψης Ιδιωτικών Φορέων και Προδιαγραφών.
Συντάσσει εισηγήσεις για τον καθορισμό των διαδικασιών συνεχούς αξιολόγησης των επιθεωρητών, εμπειρογνωμόνων και ελεγκτών του μητρώου του ΕΛ.Γ.Ο. - ΔΗΜΗΤΡΑ, υποστηρίζει τις διαδικασίες συνεχούς αξιολόγησής τους και σχετικής ενημέρωσης της αρμόδιας Διεύθυνσης Ανάπτυξης και Εφαρμογών.
Υποστηρίζει τις διαδικασίες αξιολόγησης της ορθής διενέργειας των ελέγχων και συντάσσει εισηγήσεις για την επιβολή κυρώσεων σε συνεργασία με αρμόδια στελέχη του Τμήματος Πιστοποίησης Αγροτικών προϊόντων.
Υποστηρίζει τις διαδικασίες συντονισμού και συνεργάζεται με τις αρμόδιες περιφερειακές δομές του ΕΛ.Γ.Ο. - ΔΗΜΗΤΡΑ για θέματα που άπτονται των αρμοδιοτήτων του Τμήματος.
Εισηγείται και συντάσσει διοικητικά έγγραφα που άπτονται των αρμοδιοτήτων της Υπηρεσιακής μονάδας, εφαρμόζοντας την κείμενη νομοθεσία.
Διεκπεραιώνει την αλληλογραφία του τμήματος και τηρεί σχετικό αρχείο.
Προτείνει τρόπους βελτίωσης της αποδοτικότητας και αποτελεσματικότητας της λειτουργίας του Τμήματος.
Αναλαμβάνει κάθε άλλη συναφή αρμοδιότητα που του ανατίθεται από τον Προϊστάμενο του Τμήματος.