Επισκέπτεται, παρακολουθεί και ελέγχει τη λειτουργία των δομών παροχής υπηρεσιών υγείας και πρόνοιας και συντάσσει σχετικές εκθέσεις επιθεώρησης.

Παρακολουθεί και ελέγχει την εφαρμογή του θεσμικού πλαισίου.

Παρακολουθεί και ελέγχει την τήρηση των υποχρεώσεων και δικαιωμάτων των εργαζομένων και συναλλασσόμενων στις δομές παροχής υπηρεσιών υγείας.

Ελέγχει την νόμιμη λειτουργία κάθε καταστήματος που παράγει ή εμπορεύεται ιατροτεχνολογικό ή φαρμακευτικό προϊόν.

Εκπονεί πρότυπα κανονισμών και καλών πρακτικών λειτουργίας των δομών παροχής υπηρεσιών υγείας.

Το Τμήμα Φαρμάκων και Φαρμακείων είναι αρμόδιο ιδίως για: I. Τον έλεγχο φαρμάκων. II. Την έκδοση αποφάσεων χορήγησης ναρκωτικών σε καρκινοπαθείς και μη. III. Τη θεώρηση μπλοκ χορήγησης ναρκωτικών ιδιωτών γιατρών και νοσηλευτικών ιδρυμάτων. IV. Την παρακολούθηση κίνησης ναρκωτικών και λοιπών φαρμάκων των φαρμακείων και των νοσηλευτικών ιδρυμάτων. V. Την έκδοση αδειών ίδρυσης και λειτουργίας φαρμακείων και φαρμακαποθηκών και τον έλεγχο αυτών. VI. Την παρακολούθηση Φοιτητών και Βοηθών Φαρμακείου. VII. Τη χορήγηση Άδειας Άσκησης Επαγγέλματος Φαρμακοποιού και Βοηθού Φαρμακείου. VIII. Την επιβολή κυρώσεων σε ιατρούς και οδοντιάτρους οι οποίοι αναγράφουν ναρκωτικά σε απλές συνταγές και όχι στις ειδικές για το σκοπό αυτό, καθώς και στους φαρμακοποιούς που πωλούν ναρκωτικά με απλές και όχι με ειδικές συνταγές. IX. Την εποπτεία Φαρμακευτικών Συλλόγων. X. Τον έλεγχο για την καταστροφή Ναρκωτικών φαρμάκων.