Έλεγχος της νομιμότητας και κανονικότητας δαπανών του φορέα (δικαιολογητικά, πιστώσεις προϋπολογισμού, διαθεσιμότητα πιστώσεων κ.α.) καθώς και η εκκαθάριση αυτών και η έκδοση πάσης φύσεως ενταλμάτων σύμφωνα με την κείμενη Νομοθεσία
Λογιστική παρακολούθηση και πληρωμή (εξόφληση) δημοσίων δαπανών και μισθοδοσίας
Τήρηση του μητρώου του πάσης φύσεως προσωπικού του φορέα
Έκδοση αποφάσεων έγκρισης πραγματοποίησης δαπάνης που αφορούν δαπάνες Μισθοδοσίας και Απόδοσης Κρατήσεων και την ανάρτησή τους στο Πρόγραμμα Διαύγεια, καθώς και για την έκδοση και την ανάρτηση στο Πρόγραμμα Διαύγεια και στο Κεντρικό Ηλεκτρονικό Μητρώο Δημοσίων Συμβάσεων (ΚΗΜΔΗΣ) των αποφάσεων ανάληψης υποχρέωσης, κατόπιν τεκμηριωμένου αιτήματος του διατάκτη και βεβαίωσης ύπαρξης πίστωσης υπό τον αντίστοιχο κωδικό και μη υπέρβασης των ορίων αυτής, και τελικά των αποφάσεων ανατροπής ανάληψης υποχρέωσης (ανακλητικές αποφάσεις).
Τήρηση και ενημέρωση του μισθολογικού μητρώου του με οποιαδήποτε σχέση εργασίας προσωπικού του Ε.Κ.Δ.Δ.Α. και η μέριμνα για την έκδοση βεβαιώσεων των πάσης φύσεως αποδοχών, πρόσθετων αμοιβών, αποζημιώσεων και με οποιαδήποτε άλλη ονομασία καταβαλλόμενων απολαβών για οποιαδήποτε νόμιμη χρήση, με βάση τα τηρούμενα στοιχεία.
Εκκαθάριση και ενταλματοποίηση μισθοδοσίας και υπερωριών προσωπικού Ε.Κ.Δ.Δ.Α., αποζημιώσεων μελών Δ.Σ., Υπηρεσιακού Συμβουλίου, Επιστημονικού Συμβουλίου, Κεντρικής Επιτροπής Εξετάσεων και επιτηρητών, βαθμολογητών Εισαγωγικού Διαγωνισμού της Ε.Σ.Δ.Δ.Α.
Υποβολή σε μηνιαία βάση, μέσω της μηχανογραφικής εφαρμογής της Ενιαίας Αρχής Πληρωμής (Ε.Α.Π.), του συνόλου των καταβαλλόμενων αποδοχών, πρόσθετων αμοιβών και αποζημιώσεων και του συνόλου των κρατήσεων υπέρ του Δημοσίου, υπέρ των ασφαλιστικών φορέων και υπέρ τρίτων.
Έκδοση και υποβολή της Ετήσιας Οριστικής Δήλωσης Φόρου Εισοδήματος {Δήλωσης Φόρου Μισθωτών Υπηρεσιών – Επιχειρηματικής Δραστηριότητας – Προμηθευτών}, της Ετήσιας Δήλωσης φόρου ΝΠΔΔ -Μισθωμάτων, καθώς και Δήλωσης Ακίνητης Περιουσίας όταν απαιτείται.
Έκδοση και υποβολή Αναλυτικής Περιοδικής Δήλωσης (Α.Π.Δ.) στους ασφαλιστικούς φορείς.
Εκτέλεση δικαστικών αποφάσεων σχετικών με οικονομικής φύσεως αξιώσεις τρίτων, φυσικών ή νομικών προσώπων, που συνεπάγονται επιβάρυνση στον προϋπολογισμό του Ε.Κ.Δ.Δ.Α., κατόπιν κοινοποίησης αυτών στην αρμόδια Δημοσιονομική Υπηρεσία Εποπτείας και Ελέγχου (Δ.Υ.Ε.Ε.) καθώς και η παροχή πληροφοριών και στοιχείων στις αρμόδιες δικαστικές αρχές επί θεμάτων αρμοδιότητας του Τμήματος.
Συγκέντρωση και υποβολή στο Ελεγκτικό Συνέδριο των υπεύθυνων δηλώσεων των υπαλλήλων του Ε.Κ.Δ.Δ.Α. για τυχόν πρόσθετες αμοιβές που εισέπραξαν, καθώς και η χορήγηση βεβαιώσεων πρόσθετων αμοιβών στα μέλη του Κύριου Διδακτικού Προσωπικού (Κ.Δ.Π.) του Ε.Κ.Δ.Δ.Α..
Υποβολή συγκεντρωτικής μηνιαίας κατάστασης αριθμού υπαλλήλων και δαπανών μισθοδοσίας, καθώς και παρακολούθησης μεταβολών προσωπικού ανά τρίμηνο στο Γενικό Λογιστήριο του Κράτους (Γ.Λ.Κ.) μέσω εποπτεύοντος φορέα.
Συγκέντρωση στοιχείων και η χορήγηση βεβαιώσεων και πιστοποιητικών για συνταξιοδότηση σε δικαιούχους υπαλλήλους και ασφαλιστικούς φορείς.
Χορήγηση εφάπαξ βοηθήματος ή αποζημίωσης απόλυσης σε υπαλλήλους του Ε.Κ.Δ.Δ.Α. (με σχέση εργασίας δημοσίου ή ιδιωτικού δικαίου, αντίστοιχα), για τους οποίους έχει εκδοθεί οριστική απόφαση συνταξιοδότησης.
Εκκαθάριση και η έκδοση εντολής πληρωμής των δαπανών προμήθειας αγαθών και παροχής υπηρεσιών, των πάγιων λειτουργικών δαπανών και πάσης φύσεως δαπανών που διενεργούνται στο πλαίσιο εκπλήρωσης της αποστολής του Ε.Κ.Δ.Δ.Α..
Καταχώριση στο Ηλεκτρονικό Μητρώο των πράξεων οριστικοποίησης πληρωμών (χρηματικά εντάλματα) προκειμένου για δαπάνες προμήθειας αγαθών και παροχής υπηρεσιών, σύμφωνα με τις κείμενες διατάξεις.