Επισκέπτεται, παρακολουθεί και ελέγχει τη λειτουργία των δομών παροχής υπηρεσιών υγείας και πρόνοιας και συντάσσει σχετικές εκθέσεις επιθεώρησης.
Παρακολουθεί και ελέγχει την εφαρμογή του θεσμικού πλαισίου.
Παρακολουθεί και ελέγχει την τήρηση των υποχρεώσεων και δικαιωμάτων των εργαζομένων και συναλλασσόμενων στις δομές παροχής υπηρεσιών υγείας.
Ελέγχει την νόμιμη λειτουργία κάθε καταστήματος που παράγει ή εμπορεύεται ιατροτεχνολογικό ή φαρμακευτικό προϊόν.
Εκπονεί πρότυπα κανονισμών και καλών πρακτικών λειτουργίας των δομών παροχής υπηρεσιών υγείας.
Οι αρμοδιότητες της Διεύθυνσης Δημόσιας Υγείας ανάγονται ιδίως στη διαφύλαξη και βελτίωση της υγείας και της ευεξίας του πληθυσμού, τοπικού, παγκόσμιου, μετακινούμενου και μη, μέσω πολυτομεακών συνεργασιών και πρακτικών που αποσκοπούν στην προάσπιση και προαγωγή της υγείας και της ευεξίας του ατόμου ώστε να είναι ικανό να αναπτύξει τον έλεγχο πάνω στην υγεία του και να τη βελτιώσει, στον εκσυγχρονισμό, τον έλεγχο και την προστασία των επαγγελμάτων και των υπηρεσιών υγείας, με σαφή προσανατολισμό στην ποιότητα ζωής ασθενών και μη, και με βάση τις ανάγκες ευάλωτων ομάδων του πληθυσμού, καθώς και στην προστασία και προαγωγή της υγείας με την ανάπτυξη προγραμμάτων ενημέρωσης και ευαισθητοποίησης του πληθυσμού για θέματα αγωγής υγείας, πρόληψης και προαγωγής της υγείας.
Η Διεύθυνση είναι αρμόδια ιδίως για: τη χορήγηση και ανάκληση βεβαιώσεων άσκησης επαγγελμάτων υγείας όπως κάθε φορά ορίζεται από την ισχύουσα νομοθεσία, τη χορήγηση αδειών ίδρυσης και λειτουργίας πάσης φύσεως δομών υγείας όπως προβλέπει η ισχύουσα νομοθεσία, την εποπτεία ιατρικών, οδοντιατρικών, φαρμακευτικών συλλόγων, την επιβολή κυρώσεων σε ιατρούς και οδοντιάτρους σύμφωνα με την κείμενη νομοθεσία, την επιβολή κυρώσεων σε ιατρούς και οδοντιάτρους οι οποίοι αναγράφουν ναρκωτικά σε απλές συνταγές και όχι στις ειδικές για το σκοπό αυτό, καθώς και στους φαρμακοποιούς που πωλούν ναρκωτικά με απλές και όχι με ειδικές συνταγές. Η Διεύθυνση είναι αρμόδια για την έκδοση αποφάσεων χορήγησης ναρκωτικών σε καρκινοπαθείς, τη θεώρηση μπλοκ χορήγησης ναρκωτικών ιδιωτών γιατρών και νοσηλευτικών ιδρυμάτων, την παρακολούθηση κίνησης ναρκωτικών και λοιπών φαρμάκων των φαρμακείων και των νοσηλευτικών ιδρυμάτων, την έκδοση αδειών ίδρυσης και λειτουργίας φαρμακείων, τον έλεγχο και την έγκριση πρακτικής των φοιτητών φαρμακευτικής και βοηθών φαρμακείου και την παρακολούθηση των ιατρικών ειδικοτήτων.
Στον τομέα της δημόσιας υγιεινής η Διεύθυνση είναι αρμόδια ιδίως για την εκπόνηση και εφαρμογή προγραμμάτων δημόσιας υγιεινής, τη διαφύλαξη της υγείας των ταξιδιωτών και προάσπιση της δημόσιας υγείας, τους εμβολιασμούς μετακινούμενου πληθυσμού, τη χορήγηση εμβολίων ταξιδιωτικής ιατρικής, την ενημέρωση για την αντιμετώπιση των ασθενειών και οδηγίες για νοσήματα, για την κατανάλωση νερού και τροφίμων, για τις επιδημίες λοιμωδών νοσημάτων σε διάφορες χώρες, καθώς και για τη λήψη μέτρων για την πρόληψη λοιμωδών νοσημάτων, την έκδοση και ανάκληση πιστοποιητικών άσκησης επαγγέλματος εκδιδομένων με αμοιβή προσώπων καθώς και τη συγκρότηση επιτροπής γνωμοδότησης για χορήγηση άδειας εγκατάστασης και χρήση οικήματος εντός του οποίου θα ασκείται η δραστηριότητα εκδιδομένου με αμοιβή προσώπου.
Στον τομέα της πρόληψης και προαγωγής δημόσιας υγείας, η Διεύθυνση είναι αρμόδια είναι για την ανάπτυξη των ενεργειών μέσω των οποίων τα άτομα γίνονται ικανά να αναπτύξουν τον έλεγχο πάνω στην υγεία τους και να τη βελτιώσουν. Εκπονεί και εφαρμόζει προγράμματα προληπτικής ιατρικής, οδοντιατρικής, ψυχικής υγιεινής σε συνεργασία με το καθ ύλην αρμόδιο Υπουργείο και φορείς. Επίσης είναι αρμόδιο για τη διακίνηση βιβλιαρίων υγείας του παιδιού, την παραγγελία - παραλαβή εμβολίων και χορήγηση τους σε υπηρεσίες και φορείς της Περιφέρειας, την εκπόνηση και εφαρμογή σχεδίων δράσης για την αντιμετώπιση επιδημιών, λοιμωδών νοσημάτων, την επιδημιολογική επιτήρηση και διερεύνησή τους, καθώς και τη λήψη μέτρων για την πρόληψη αυτών με σκοπό την προστασία της δημόσιας υγείας
Στο τομέα της υγειονομικής ασφάλειας η Διεύθυνση είναι αρμόδια για την εξασφάλιση της δημόσιας υγείας με τον υγειονομικό έλεγχο και ιδίως για την εφαρμογή της υγειονομικής νομοθεσίας, την έκδοση αποφάσεων τοπικών υγειονομικών διατάξεων, τη λήψη μέτρων σε θέματα δημόσιας υγιεινής, την επιβολή κυρώσεων, την έκδοση γνωματεύσεων για τη χορήγηση αδειών των επιχειρήσεων υγειονομικού ενδιαφέροντος όπου αυτή απαιτείται, για την εξασφάλιση της υγιεινής του περιβάλλοντος, για την έκδοση γνωματεύσεων για άδεια διάθεσης αποβλήτων όπου προβλέπεται, ηχομετρήσεις, έλεγχο ύδρευσης και για τη λήψη μέτρων σε θέματα υγιεινής περιβάλλοντος, καθώς και για αρμοδιότητες δημόσιας υγιεινής και ταξιδιωτικής ιατρικής μεταφοράς οστών και σωρών.
Η Διεύθυνση και τα τμήματά της συνεργάζονται με τη Διεύθυνση Καινοτομίας και Τεκμηρίωσης (DataCenter) για την καταγραφή των δεδομένων και πληροφοριών του κοινωνικού χάρτη της Περιφέρειας.
Η Διεύθυνση ασκεί κάθε άλλη αρμοδιότητα που σχετίζεται με την Δημόσια Υγεία όπως κάθε φορά ανατίθεται στην Περιφέρεια.