Σχεδιάζει, συντονίζει ή/και υλοποιεί τις εθνικές στρατηγικές του αγροτικού τομέα.
Προτείνει ή/και υλοποιεί τις εθνικές πολιτικές του αγροτικού τομέα.
Συμπράττει στη διαμόρφωση, υλοποίηση ή/και ενσωμάτωση του διεθνούς και ενωσιακού δικαίου στο εθνικό δίκαιο και ελέγχει την εφαρμογή τους.
Σχεδιάζει, συντονίζει ή/και υλοποιεί προγράμματα δράσεων και ελέγχων για την ανάπτυξη του αγροτικού τομέα και την αγρο-διατροφική υγιεινή και ασφάλεια.
Λαμβάνει τα απαιτούμενα μέτρα για τον εντοπισμό, την καταγραφή και την επίλυση προβλημάτων που συνδέονται με τη βιώσιμη ανάπτυξη του αγροτικού τομέα.
Ελέγχει τη συμμόρφωση με τις απαιτήσεις παραγωγής και εμπορίας αγροτικών προϊόντων.
Συντονίζει τις ενέργειες για τον φυτοϋγειονομικό έλεγχο, τον έλεγχο των διακινούμενων φυτοπροστατευτικών προϊόντων και τον έλεγχο επί των εκμεταλλεύσεων - επιχειρήσεων και ενώσεων αυτών που εμπλέκονται σε οποιοδήποτε στάδιο παράγωγής - εμπορίας φυτών και φυτικών προϊόντων
Μεριμνά για την ανάπτυξη και την ποιοτική βελτίωση των τομέων της φυτικής και ζωικής παραγωγής στην περιοχή της Περιφερειακής Ενότητας
Συντονίζει τις ενέργειες για την προώθηση της εκμηχάνισης και εξηλεκτρισμού της γεωργίας.
Συντονίζει τη λήψη των αναγκαίων μέτρων για την ανάπτυξη και τον εκσυγχρονισμό των αγροτικών εκμεταλλεύσεων, την ανάπτυξη επιχειρήσεων ιχθυοκαλλιέργειας εντός ιχθυοτρόφων υδάτων και μονάδων συσκευασίας, μεταποίησης και εμπορίας αλιευμάτων στην Π.Ε. αρμοδιότητας της Διεύθυνσης
Συντονίζει τη διενέργεια ελέγχων σύμφωνα με την κείμενη νομοθεσία για την προστασία του ζωικού κεφαλαίου, την εξασφάλιση της υγείας των ζώων και τη λήψη μέτρων για την προστασία της δημόσιας υγείας.
Ασκεί τις αρμοδιότητες του Ενδιάμεσου Φορέα Διαχείρισης δράσεων του ΠΑΑ 2014-2020 σύμφωνα με την ΥΑ 2545/2016(ΦΕΚ Β 3447/25.10.2016) όπως ισχύει και με τις εκάστοτε ισχύουσες διατάξεις