Σχεδιάζει, συντονίζει ή/και υλοποιεί τις εθνικές στρατηγικές του αλιευτικού τομέα.

Προτείνει ή/και υλοποιεί τις εθνικές πολιτικές του αλιευτικού τομέα.

Συμπράττει στη διαμόρφωση, υλοποίηση ή/και ενσωμάτωση του διεθνούς και ενωσιακού δικαίου στο εθνικό δίκαιο και ελέγχει την εφαρμογή τους.

Σχεδιάζει, συντονίζει ή/και υλοποιεί προγράμματα δράσεων για την ανάπτυξη του αλιευτικού τομέα.

Λαμβάνει τα απαιτούμενα μέτρα για τον εντοπισμό, την καταγραφή ή/και την επίλυση προβλημάτων που συνδέονται με την αλιευτική παραγωγή και την αξιοποίηση των αλιευτικών προϊόντων.

Μεριμνά για την εφαρμογή του ελέγχου τήρησης των κανόνων στο πλαίσιο της ενωσιακής και εθνικής αλιευτικής νομοθεσίας.

Ελέγχει τη συμμόρφωση με τις απαιτήσεις παραγωγής και εμπορίας αλιευτικών προϊόντων.

Το Τμήμα Αλιείας Περιφερειακής Ενότητας Καλύμνου είναι ιδίως αρμόδιο για την έκδοση βεβαίωσης πώλησης αλιευμάτων ιδίας παραγωγής, την ηλεκτρονική αποδοχή αιτημάτων χορήγησης αδειών απόπλου στα αλιευτικά σκάφη για τη διενέργεια αλιείας στα διεθνή ύδατα και ειδικών αδειών αλίευσης μεγάλων πελαγικών ψαριών, την έγκριση για διενέργεια αθλητικής αλιείας, την έγκριση χορήγησης επαγγελματικής άδειας αλιείας σκάφους και χορήγηση ΑΜΑΣ, την έγκριση μεταβίβασης κυριότητας επαγγελματικού αλιευτικού σκάφους, την έγκριση αντικατάστασης αλιευτικού σκάφους, την έγκριση αντικατάστασης μηχανής αλιευτικού σκάφους, έλεγχος και αποδοχή ηλεκτρονικών αιτήσεων για: α) την χορήγηση έγκρισης αδειών απόπλου για αλιεία στα διεθνή ύδατα, β) αδειών αλίευσης μικρών πελαγικών και γ) παρασυρόμενων διχτών (μηχανότρατας), χορήγηση ειδικών αδειών αλίευσης βιντζότρατας, οστράκων δολωμάτων, ολοθούριων, γνωμοδότηση για την παραχώρηση θαλάσσιων εκτάσεων για εγκατάσταση – επέκταση - μονάδων υδατοκαλλιέργειας, έλεγχος μονάδων υδατοκαλλιέργειας, παρακολούθηση μακροχρόνιων δεσμεύσεων μονάδων υδατοκαλλιέργειας & αλιευτικών σκαφών που έτυχαν οικονομικής ενίσχυσης.