Σχεδιάζει, συντονίζει και υλοποιεί τις εθνικές στρατηγικές των τομέων αρμοδιότητας.
Προτείνει και υλοποιεί τις εθνικές πολιτικές των τομέων αρμοδιότητας.
Συμπράττει στη διαμόρφωση, υλοποίηση ή/και ενσωμάτωση του διεθνούς και ενωσιακού δικαίου στο εθνικό δίκαιο και ελέγχει την εφαρμογή τους.
Σχεδιάζει, συντονίζει, ελέγχει και αξιολογεί σχέδια δράσεων και ελέγχων για την ανάπτυξη της αγροδιατροφικής αλυσίδας στους τομείς αρμοδιότητας.
Ελέγχει τη συμμόρφωση με τις υγειονομικές απαιτήσεις του εμπορίου ζώντων ζώων, τροφίμων ζωικής προέλευσης και ζωικών υποπροϊόντων.
Εντοπίζει και καταγράφει προβλήματα που συνδέονται με τη βιώσιμη ανάπτυξη των τομέων αρμοδιότητας και καταθέτει προτάσεις για την αντιμετώπισή τους.
Διαχειρίζεται και διενεργεί εργαστηριακές αναλύσεις και εκπαιδεύσεις
Υλοποίηση της ισχύουσας νομοθεσίας για την Ατομική Σήμανση, καταγραφή και παρακολούθηση όλων των παραγωγικών ζώων και την διαχείριση της Κτηνιατρικής Βάσης Δεδομένων(ΟΠΣ-Κ)
Συμμετοχή σε επιτροπές ή κλιμάκια, για την χορήγηση ή ανάκληση άδειών ή εγκρίσεων, σε εγκαταστάσεις παραγωγής, επεξεργασίας και διάθεσης προϊόντων ζωικής προέλευσης, Ζωικών Υποπροϊόντων καθώς και σε εγκαταστάσεις αναπαραγωγής και εμπορίας ζώων συντροφιάς
διενέργεια των πάσης φύσεως ελέγχων για την προστασία των ζώων κατά την εκτροφή, την μεταφορά, τη σφαγή ή την θανάτωση τους
Παροχή τεχνικών συμβουλών επιστημονικής συμπαράστασης στους κτηνοτρόφους σε διάφορα θέματα αρμοδιότητας του τομέα