Σχεδιάζει, συντονίζει ή/και υλοποιεί τις εθνικές στρατηγικές του αγροτικού τομέα.

Προτείνει ή/και υλοποιεί τις εθνικές πολιτικές του αγροτικού τομέα.

Συμπράττει στη διαμόρφωση, υλοποίηση ή/και ενσωμάτωση του διεθνούς και ενωσιακού δικαίου στο εθνικό δίκαιο και ελέγχει την εφαρμογή τους.

Σχεδιάζει, συντονίζει ή/και υλοποιεί προγράμματα δράσεων και ελέγχων για την ανάπτυξη του αγροτικού τομέα και την αγρο-διατροφική υγιεινή και ασφάλεια.

Λαμβάνει τα απαιτούμενα μέτρα για τον εντοπισμό, την καταγραφή και την επίλυση προβλημάτων που συνδέονται με τη βιώσιμη ανάπτυξη του αγροτικού τομέα.

Ελέγχει τη συμμόρφωση με τις απαιτήσεις παραγωγής και εμπορίας αγροτικών προϊόντων.

Το Τμήμα Ζωικής Παραγωγής Κυκλάδων είναι αρμόδιο ιδίως για: i. Τον ορισμό στοχοθεσίας, τον προγραμματισμό και την κατάστρωση ετήσιων χρονοδιαγραμμάτων δράσεων και τον απολογισμό δραστηριοτήτων των τομέων ζωικής παραγωγής της Περιφέρειας σε συνεργασία με τις συναρμόδιες Υπηρεσίες της Γενικής Διεύθυνσης Παραγωγικών Τομέων, ii. τη συνεργασία με τα λοιπά Τμήματα της Διεύθυνσης για υποβολή προγραμμάτων, προώθησης και προβολής αλιευτικών και αγροτικών προϊόντων φυτικής, αλιευτικής και ζωικής παραγωγής, για την από κοινού προετοιμασία, διενέργεια διαδικασιών για την υποβολή και ένταξή τους σε διεθνή, ευρωπαϊκά και εθνικά προγράμματα και την υλοποίηση του φυσικού και οικονομικού αντικειμένου τους, iii. τη μελέτη και αξιοποίηση των στοιχείων της παραγωγικής διαδικασίας και για τη μέριμνα για την εφαρμογή των προγραμμάτων βελτίωσης της ποιότητας προϊόντων ζωικής παραγωγής. Το Τμήμα είναι αρμόδιο για κάθε άλλο θέμα που αφορά την ανάπτυξη της ζωικής παραγωγής στην περιοχή των Κυκλάδων που δεν ανατίθεται ρητώς σε έτερο τμήμα της Διεύθυνσης.