Σχεδιάζει, συντονίζει ή/και υλοποιεί τις εθνικές στρατηγικές του αγροτικού τομέα.
Προτείνει ή/και υλοποιεί τις εθνικές πολιτικές του αγροτικού τομέα.
Συμπράττει στη διαμόρφωση, υλοποίηση ή/και ενσωμάτωση του διεθνούς και ενωσιακού δικαίου στο εθνικό δίκαιο και ελέγχει την εφαρμογή τους.
Σχεδιάζει, συντονίζει ή/και υλοποιεί προγράμματα δράσεων και ελέγχων για την ανάπτυξη του αγροτικού τομέα και την αγρο-διατροφική υγιεινή και ασφάλεια.
Λαμβάνει τα απαιτούμενα μέτρα για τον εντοπισμό, την καταγραφή και την επίλυση προβλημάτων που συνδέονται με τη βιώσιμη ανάπτυξη του αγροτικού τομέα.
Ελέγχει τη συμμόρφωση με τις απαιτήσεις παραγωγής και εμπορίας αγροτικών προϊόντων.
Είναι αρμόδιος ιδίως για το φυτοϋγειονομικό έλεγχο εισαγομένων-εξαγομένων και ενδοκοινοτικής διακίνησης φυτών, φυτικών μερών και φυτικών προϊόντων, τον φυτοϋγειονομικό έλεγχο πολλαπλασιαστικού υλικού και
των φυτωρίων, τη χορήγηση πιστοποιητικού φυτοϋγείας και φυτοϋγεινονομικού διαβατηρίου, τη σύνταξη σχε-
δίων δράσης για την παρεμπόδιση εισόδου ή/και την εξάλειψη, τον περιορισμό επιβλαβών οργανισμών, τη δι-
ενέργεια προγράμματος επισκοπήσεων για εχθρούς και ασθένειες καραντίνας, τον ποιοτικό έλεγχο νωπών οπω-
ροκηπευτικών και κατεψυγμένων προϊόντων φυτικής προέλευσης, την εφαρμογή προγράμματος δακοκτονίας,
αρουραιοκτονίας και ακριδοκτονίας, την επισήμανση και την παρακολούθηση της εξέλιξης εχθρών και ασθενει-
ών των καλλιεργειών και την εφαρμογή μέτρων για την αντιμετώπισή τους, τον έλεγχο της εμπορίας και χρήσης
των φυτοπροστατευτικών προϊόντων και τον έλεγχο επί των εκμεταλλεύσεων, επιχειρήσεων και ενώσεων αυτών, που εμπλέκονται σε οποιοδήποτε στάδιο παραγωγής και εμπορίας φυτών και των υπολειμμάτων φυτοφαρμάκων επί των φυτικών προϊόντων. Ομοίως, τον έλεγχο διακίνησης και χρήσης των βιοκτόνων και των επιχειρήσεων απεντομώσεων -τρωκτικοκτονιών. Επίσης αντικείμενο απασχόλησής τους είναι :
οι έλεγχοι στα πλαίσια των Πολυετών Ολοκληρωμένων Εθνικών Σχεδίων Ελέγχου (ΠΟΕΣΕ) καθώς και ο έλεγχος των εγκαταστάσεων και η επιθεώρηση HACCP των μεταποιητικών μονάδων τροφίμων φυτικής προέλευσης, η τήρηση του Μητρώου Εμπόρων Νωπών Οπωροκηπευτικών (MENO) και του Κεντρικού Ηλεκτρονικού Μητρώου Οικοτεχνίας (ΚΗΜΟ).