Συντονίζει και ελέγχει τον προγραμματισμό του έργου, τη σύνταξη προϋπολογισμού, την παρακολούθηση των χρηματοδοτικών ροών και τη συνεργασία με τους χρηματοδοτικούς φορείς.

Ελέγχει την πορεία υλοποίησης του φυσικού και του οικονομικού αντικείμενου του έργου και εισηγείται σε ανώτερο ιεραρχικά επίπεδο, αναγκαίες τροποποιήσεις στο φυσικό ή/και στο οικονομικό αντικείμενο εφόσον αυτό απαιτείται.

Εφαρμόζει και ελέγχει την τήρηση συστήματος οικονομικής διαχείρισης.

Συντονίζει, ελέγχει και αξιολογεί τα μέλη της ομάδας έργου.

Ελέγχει την τήρηση των συμφωνηθέντων με τον ανάδοχο/ υπεργολάβους/ παραχωρησιούχους / εκπροσώπους εξωτερικών φορέων (ως προς το έργο) που επηρεάζουν το έργο και άλλα τρίτα μέρη.

Συντονίζει τον έλεγχο της ποιότητας του έργου και εισηγείται για την ανάληψη τυχόν απαραίτητων διορθωτικών ενεργειών.

Παρέχει υποστήριξη στους ελέγχους (δημοσιονομικούς, διαχειριστικούς, φυσικής προόδου κ.λπ.) που διενεργούν οι ελεγκτικές υπηρεσίες και επιτροπές των Κοινοτικών Ταμείων, εφόσον συγχρηματοδοτούν το εν λόγω έργο.

Ελέγχει τον τελικό απολογισμό του φυσικού και οικονομικού αντικειμένου του έργου και συντονίζει τις διαδικασίες για την ολοκλήρωση και παραλαβή του έργου-μελέτης-υπηρεσίας.

Στο Τμήμα Τεχνικής Υποστήριξης μικρών Δήμων υπάγονται αρμοδιότητες εκτέλεσης έργων και μελετών για τους Δήμους της Περιφέρειας με πληθυσμό μέχρι 4000 κατοίκους σύμφωνα με τη διαδικασία που προβλέπεται στο άρθρο 205 παρ. 4 του ν.3852/2010. Στο Τμήμα αυτό ακόμη μπορεί να ανατίθεται από τη Διεύθυνση Τεχνικών Έργων Κυκλάδων η επίβλεψη έργων που εκτελούνται από την Περιφέρεια σε νησιά του νομού Κυκλάδων.